


学校前身可追溯至1957年创办的南京市光华门中学。1991年,光华门中学更名为"南京市行知实验中学"。2004年3月,学校被转评为江苏省四星级普通高中;同年,南京市行知实验中学与南京市中山中学、南京市石门坎中学、南京市牌楼中学四校合并,组建新的南京市行知实验中学。2011年,学校降为江苏省三星级普通高中。2018年秋季起,学校停止招收高一新生;同年11月28日,南京市教育局、南京市秦淮区人民政府与南京师范大学附属中学举行签约暨揭牌仪式,将学校纳入南师附中教育集团,停办高中,转办为一所初级中学,校址不变,挂牌"南京师范大学附属中学行知分校",新校于2019年开始招生。
学校继承并实践陶行知先生"生活即教育、教学做合一"的教育思想,秉承"人性向善,生命向上"的人文理念。学校践行孙中山先生的博爱思想,致力于发展和完善被教育部定名的"行知实验中学"培养模式,曾被江苏省教育厅誉为"教育改革的旗帜 创新办学的典范"。
学校位于南京市秦淮区海福巷73号,由南京市秦淮区教育局主管。校内设有香港"何崇本"奖学金和助学金,用于奖励优秀学生和扶助家庭贫困学生。
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