


2016年9月,三明市梅列区第二实验学校正式招生,当年招收初中1个班、小学3个班,借用梅列区第一实验学校校舍办学。2018年,根据《三明市人民政府办公室关于推进市区基础教育总校制办学意见(试行)》文件精神,学校与梅列区第一实验学校共同作为梅列区总校制办学改革试点首批单位。2021年2月3日,福建省人民政府批复撤销梅列区、三元区,设立新的三元区;同年9月,学校更名为"三元区第二实验学校"。2024年6月,学校地址由"三明市梅列区碧桂园路37号"变更为"福建省三明市三元区徐碧街道碧桂园路37号"。
学校为九年一贯制公办学校,实施中小学义务教育。截至2021年9月,办学规模达54个教学班,在校学生2660人。2021年4月,学校启动艺体馆改造工程,总投资74.8万元,工期50天,由中建华林(福建)建设有限公司承建。2025年9月,学校启动"三明市三元区第二实验学校(M2)海绵化改造工程",项目用地红线面积48564平方米,总投资686.06万元,工期12个月。校训为"潜思力行"。
学校秉承三明传统核心文化——闽学文化,确立"开放·多元·幸福·卓越"的办学理念,培养"善德·善学·善处·善行"的育人目标;校风为"温暖有序、阳光有责",教风为"明理至善",学风为"循序致精"。学校推行社区化课程,构建象征智慧、心灵与实践的"3H"课程体系,涵盖儿童诗配画、人工智能、乐器、融+课程等模块。2023年,学校承办了海峡两岸暨港澳地区基础教育交流活动。
足球教育方面,学校分别于2018年9月和2021年1月两次被教育部认定为"全国青少年校园足球特色学校"。艺术教育方面,2019年8月,学校舞蹈《战地红花》登上央视国际频道《大手牵小手》节目,并获得三明市艺术节展演一等奖。阅读教育方面,学校建立"新阅图书馆",开设每周一节的阅读课,搭建"新阅读书吧"、班级图书角、读书通道、阅读走廊等多元化阅读空间,并构建"立体多元"的"读书达人"评价体系。
学校先后获评全国新教育实验学校、全国青少年校园足球特色学校、福建省美术教育基地培育学校;2023年入选全国青少年学生读书行动"书香校园";责任督学督导案例获2022年福建省中小学校幼儿园责任督学挂牌督导优秀案例二等奖;《净化水质探秘 科学》案例入选2023年福建省小学科学实践活动优秀案例。学校少先队被评为"三明市优秀大队"。
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