


学校原校舍建于1905年(清光绪三十一年),由明代寺庙大佛寺改建而成,初称"大佛寺小学",后因地处"兴仁村"而改称"兴仁小学"。此后,方国瑜教授捐资为学校修建教学大楼,学校遂更名为"丽江兴仁方国瑜小学"。
兴仁方国瑜小学隶属于丽江市古城区大研中心校。大研中心校下辖六所完全小学及一所幼儿园,分别为大研中心小学、兴仁方国瑜小学、现文小学、兴文小学、汝吉小学、友谊小学和黄山幼儿园,除友谊小学外其他学校均坐落于丽江古城。
学校校内的区级文物保护单位大佛寺于2023至2024年完成维护保养和翻修,并建设了"丽江古城世界文化遗产保护宣传教育中心"。2024年12月4日,联合国教科文组织亚太地区世界遗产培训与研究中心苏州分中心向丽江古城授予"世界遗产青少年教育基地"称号,设于学校内的上述中心成为该教育基地的所在地。
学校是丽江最早开展纳西文化教育的学校之一。1997年前后,时任校长杨一红在任内组织开设了纳西母语班;1998年起,学校明确以"学纳西文化,办特色学校"为方向。学校编写了《纳西文化进课堂》课程,开设纳西古乐、七星刺绣、编黑白辫子等特色课程。纳西古乐教学由玉龙县纳西古乐传承学会会长李国群等担任校外指导;七星刺绣则由学校选拔的9名教师向纳西传统服饰制作传承人学习后任教。2025年12月,来自"联合国教科文组织世界遗产志愿者倡议——丽江古城世界文化遗产青年创变营"的志愿者曾走进该校,开展以世界遗产为主题的遗产教育课堂。
2020年,学校被评为全国青少年校园足球特色学校。2022年,学校学生李江涛被评为"新时代云南好少年"。
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