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学院始建于1948年6月,前身为松江省呼兰农林技术专门学校,是当时松江省第一所中等农林学校。1950年春,松江省农林厅在佳木斯市南郊选定新校址,正式成立松江省佳木斯农林高级职业学校。1952年,学校易名为松江省农业技术学校;1954年定名为黑龙江省佳木斯农业学校,被中央教育部评为全国重点中等农业学校。此后历经东北农学院合江分院、合江地区"五七"中等专业学校、合江地区"五七"大学、黑龙江省佳木斯农业学校等时期。2001年3月,经黑龙江省人民政府批准、教育部备案,在省内首批由中专学校晋升为高职学院,更名为黑龙江农业职业技术学院,步入全国普通高等院校行列。
学院占地面积共计55.5万平方米,校舍总建筑面积21.1万平方米,固定资产总值3.5亿元。校内实训基地175个、校外实训基地137个,另有职业教育仿真实训资源共391套,覆盖多个重点专业领域。
学院设有农学系、动物科学系、信息工程系、机电工程系、现代服务管理系、建筑工程系、马克思主义理论课教研部7个教学系(部),开设涵盖理、工、农、经等学科门类的34个高职专业,建有3个省级高水平专业群、1门国家级精品在线课程、11门省级精品课程、1门省级一流核心课。截至2026年6月,在籍学生8181人。
学院现有教职工505人,其中专任教师369人,教授26人,副教授76人,博士2人,硕士209人,"双师型"专任教师205人,校外教师154人。先后涌现出国家级课程思政教学名师3人、全国农业职业教育教学名师4人、省级名师4人、省级模范教师1人、省级教学新秀1人、省级师德先进个人8人,并入选第六批佳木斯市有突出贡献专业技术人才3人。
2023年,学院牵头成立佳木斯国家农高区现代农业产教联合体,并获批教育部首批28家国家级市域产教联合体建设单位;牵头成立国家粳稻加工产教融合共同体和东北生猪产教融合共同体。2024年,学院牵头组建俄罗斯远东植保农业无人机"开物工坊",并入选黑龙江省职业院校"开物工坊"立项建设名单。此外,学院还与深圳市优必选科技股份有限公司合作共建具身人工智能产业学院。
学院先后被授予国家高职高专人才培养工作水平评估"优秀"院校、首批省级"骨干高职院校"、黑龙江省"教育系统先进集体"、省级"学生工作先进集体"、全省"高等学院毕业生就业工作先进集体"、省级"花园式学校"、省级"高校文明校园标兵"、教育部首批"'1+X'证书试点院校"、"省级信息化标杆学校"、国家"现代学徒制试点院校"等称号,并连续两次入选黑龙江省"双高计划"建设单位。
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